Фамилия Бакановский — вариант более распространённой фамилии Баканов, но с характерным суффиксом -ский, который указывает на географическое происхождение или принадлежность к местности. В основе лежит прозвище Бакан. Так на Руси называли красильный лак — краску из органических веществ (красных, жёлтых, зелёных) в соединении с металлическими основаниями. Чаще всего баканом именовали багряную краску, добывавшуюся из червца (насекомое Coccus — «кошениль») и марены (растение Rubia tinctorum — «красильный корень»).

Отсюда ясно, кем мог быть первый носитель прозвища: художник, иконописец, красильщик тканей. Фамилия Баканов была особенно распространена среди «богомазов» (иконописцев) в Шуе, Палехе и Иванове — центрах иконописного промысла. Форма Бакановский, скорее всего, закрепилась за выходцем из населённого пункта с названием вроде Баканово или Бакановка: такие топонимы встречаются в западных и южных регионах России, а также на Украине. Суффикс -ский как раз и превращает топоним в фамилию, отвечая на вопрос «откуда родом?».

В документах XVI века Веселовский упоминает Бакана Дмитриевича Тютчева (Зубцов). Прозвище Бакан со временем полностью заменило наследственное имя — сначала в быту, затем в официальных записях. Так что носители фамилии Бакановский могли быть и потомками красильщика, и переселенцами из деревни, названной в честь такого же прозвища.