Фамилия Баканина — одна из тех, что прямо указывает на занятие предка. В её основе лежит прозвище Баканя, а оно, в свою очередь, восходит к слову «бакан». Так в старину называли красильный лак: краску из органических веществ, которую соединяли с металлическими основаниями, чтобы получить красный, жёлтый или зелёный оттенок.

Скорее всего, первый носитель прозвища был связан с изготовлением или нанесением этой краски. Это мог быть художник, иконописец или красильщик тканей. Догадку подтверждает история: фамилия Баканов была особенно распространена среди «богомазов» — иконописцев из Шуи, Палеха и Иванова. Документы сохранили и имя Бакан Дмитриевич Тютчев, живший в XVI веке в Зубцове (этот факт приводит исследователь С. Веселовский). Так что прозвище Баканя, а затем и фамилия Баканина, закрепились за потомками мастеров, работавших с яркими пигментами.

Если посмотреть на словообразовательную модель, то фамилия образована с помощью типичного русского суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Баканин, то есть сын или потомок Бакани. Женская форма Баканина закрепилась как фамилия, передающаяся по наследству. В отличие от более распространённой фамилии Баканов, вариант Баканина встречается реже, но говорит о том же ремесле — работе с краской и цветом.