Фамилия Баханко звучит как типичная украинская или белорусская, и её разбор подтверждает это. В основе лежит суффикс -ко, который в восточнославянских языках, особенно в украинском, выполнял роль уменьшительно-ласкательного или патронимического показателя. По сути, это фамилия-прозвище, образованная от личного имени или характеристики человека.

Корень «Бахан» может восходить к нескольким источникам. Самая прямая версия — от украинского глагола «бахати» (громко стучать, хлопать, бить) или существительного «бахання» (грохот, шум). В таком случае прозвище Баханко могли дать шумному, громкому человеку, который не привык ходить тихо. Вторая версия — от имени Бахан, которое могло быть народной формой крестильного имени Варфоломей (через чередование В/Б и усечение) или тюркского имени Бахан (в значении «господин», «владыка»). Третья, менее вероятная, но возможная в южнорусских говорах, — от слова «бахан» как названия растения (например, белены или болиголова), то есть прозвище могло относиться к знахарю или просто к человеку с «дурманящим» характером.

Суффикс -ко в фамилиях типа Баханко, Коваленко, Шевченко исторически указывал на принадлежность к роду: «сын Бахана» или «маленький Бахан». В польских и белорусских землях похожая фамилия (Bachanko) могла возникать без географической привязки к Украине. Социально фамилия не элитарная — она характерна для крестьянского и казачьего сословия, где прозвища были живыми и описывали реальные черты человека.

В современных записях Баханко встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси (Брестская область). В России фамилия редкая и, скорее всего, принесена мигрантами из этих регионов. Отдельного дворянского рода с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её народное происхождение.