Фамилия Бахилины, как и многие русские фамилии, образована от личного прозвища. Разбираем её по косточкам: в основе лежит прозвище Бахил (или Бахило), а суффикс -ин указывает на принадлежность — буквально «сын Бахила» или «из семьи Бахила».

Самый прямой и очевидный путь происхождения — от слова «бахилы». Так на Руси называли высокие, прочные сапоги, чаще всего рабочие или охотничьи. Прозвище Бахил мог получить либо сапожник, который эти бахилы тачал, либо человек, который их постоянно носил — например, рыбак, охотник или крестьянин, работавший в болотистой местности. Эта версия лежит на поверхности и не требует сложных лингвистических допущений.

Существует и вторая, более экзотическая гипотеза. Она ведёт фамилию к восточному имени Бакхил. В арабском языке имя Бакхил (или Баххил) имеет значение «красивый, прелестный». В татарском языке созвучное слово может означать «могущественный клинок» — такое имя давали мальчикам с пожеланием стойкости и силы в противостоянии врагам. Однако эта версия сталкивается с фонетической проблемой: в русском языке восточное «Бакхил» неизбежно превратилось бы в «Бахтил» или «Бахтыл», а не в «Бахил». Переход «кх» в простое «х» без оглушения и появления гласной маловероятен, поэтому версия с арабско-татарским корнем заметно слабее бытовой, «сапожной».

Суффикс -ин в фамилии Бахилин — классическая русская патронимическая модель. В северных и центральных областях России (Архангельская, Вологодская, Владимирская губернии) фамилии на -ин так же распространены, как на -ов, и указывают на прозвище, оканчивающееся на -а или -я. Прозвище Бахило идеально ложится в эту модель.

Таким образом, наиболее вероятно, что предок современных Бахилиных был мастеровым человеком — сапожником, шившим грубую рабочую обувь, или же просто получил прозвище по характерной детали одежды. Фамилия эта — живое напоминание о быте и ремёслах Древней Руси, где прозвище по обуви было не менее естественно, чем по шапке или кафтану.