Фамилия Бахун — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, без типичных суффиксов -ов или -ин. Это так называемая «неоформленная» фамилия, которая застыла в форме исходного слова. Встречается она преимущественно в западных и южных регионах России, а также на Украине, что сразу наводит на мысль о диалектном или украинском происхождении основы.

Корень здесь — «бах-», звукоподражательный. В русских и украинских говорах «бахнуть» значит ударить, грохнуть, выстрелить. Отсюда «бахун» — человек, который любит шумно хлопнуть дверью, громко рассмеяться или, в переносном смысле, резкий, вспыльчивый, «взрывной» по характеру. Не исключено, что так могли прозвать пушкаря или охотника — того, кто постоянно «бахает».

Есть и вторая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «бахун» — это растение, разновидность полыни ( Artemisia abrotanum ), известной как «божье дерево» или «богородская трава». В этом случае прозвище мог получить травник, знахарь или просто человек, живший в местности, где росла эта пахучая трава. Однако звукоподражательная версия перевешивает: фамилии от названий растений чаще образуются через суффиксы (Бахунов, Бахунин), а форма Бахун характерна именно для прозвищ-характеристик.

С точки зрения словообразования, фамилия Бахун стоит в одном ряду с такими же бессуффиксными прозвищами, как Гром, Стук, Звон. В украинской ономастике эта модель особенно живуча — вспомним фамилии Голуб, Коваль, Швець. Бахун, скорее всего, из того же гнезда: сначала человека дразнили за шумный нрав, а потом прозвище закрепилось за его потомками. Документальных подтверждений древности фамилии нет, но по косвенным признакам — отсутствию дворянских гербов и сословных привилегий — можно уверенно говорить, что родоначальник Бахунов был из крестьян или казаков.