Фамилия Баккулов — тюркская по происхождению, образована от мусульманского мужского имени Баккул. Её основа составная, что характерно для многих восточных имён. Первая часть восходит к древне-казахскому «бак» — «дар, счастье, удача». Вторая часть — «кул»: в древнетюркском языке это слово означало не только «раб» или «слуга», но и «раб Аллаха», «товарищ», «спутник», «воин», «хлебопашец». Такая многозначность — ключ к пониманию фамилии.

Самая прямая и правдоподобная версия перевода имени Баккул — «удачливый товарищ». Встречается и вариант «счастливый раб Аллаха», но он менее вероятен: в тюркской антропонимии компонент «кул» чаще указывал на социальную или дружескую связь, чем на религиозное смирение. Формант -ов в фамилии — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («сын Баккула»).

Фамилия редкая, её география узкая. Встречается преимущественно у народов, говорящих на тюркских языках, — казахов, башкир, татар, а также у тех, кто исторически жил в зоне их культурного влияния. В русских документах фамилия фиксируется с XIX века, когда в империи начали массово записывать инородцев по отчеству с суффиксом -ов. До этого носители имени Баккул обходились без фамилий, используя только личное имя с указанием отца.

От той же основы образованы фамилии Баккулиев, Баккуловский, но они ещё реже. Написание с двумя «к» (Баккулов, а не Бакулов) указывает на тюркский долгий согласный — в оригинале имя звучало с удвоением. В бытовой речи фамилию иногда путают с Бакулов (от топонима Баку), но это разные корни.