Фамилия Баклажкина — женская форма от мужской Баклажкин, и её основа сразу отсылает к предмету быта, а не к растению, как может показаться на первый взгляд. В русских говорах «баклажка» — это небольшая плоская фляга для воды или вина, которую брали в дорогу. Слово пришло из тюркских языков (ср. «баклак» — сосуд для воды), но в русском языке обросло уменьшительным суффиксом -к-.

Фамилию образовали по продуктивной модели: прозвище или профессия → суффикс -ин (притяжательный, указывающий на принадлежность: «чей?» — Баклажкин). Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода на -а/-я. Таким образом, Баклажкин — это «сын (или потомок) Баклажки».

Кем мог быть этот Баклажка? Скорее всего, прозвище дали человеку, который постоянно носил с собой баклажку — либо по роду занятий (водонос, бурлак, разносчик вина), либо за привычку. В ономастике известен принцип: прозвище по предмету, который человек постоянно использует или носит при себе. Альтернативная версия — Баклажкой могли прозвать мастера, который делал такие фляги (бондаря или жестянщика), но она менее вероятна: в русской традиции ремесленников чаще называли по готовому изделию с суффиксом -ник (Баклажник).

Географически фамилия редкая и, по данным современных телефонных справочников, встречается в основном в центральных и южных регионах России — там, где были развиты торговые пути и бурлачество. В дореволюционных переписях Баклажкины фиксировались в среде крестьян и мещан, то есть фамилия не аристократическая, а бытовая, народная.

Стоит заметить: несмотря на внешнее сходство, фамилия Баклажкин не связана с овощем баклажан. Слово «баклажан» пришло в русский язык позже (из персидского через турецкий) и имеет другую корневую структуру. Если бы фамилия происходила от овоща, она звучала бы как Баклажанов или Баклажанкин — с суффиксом -ан-, который в реальной фамилии отсутствует. Так что предок современных Баклажкиных, скорее всего, не огородничал, а ходил по воде или торговал разливным вином.