Фамилия Баклажко — одна из тех, что хранят в себе прямое указание на занятие или бытовую деталь из жизни предка. В её основе лежит прозвище Баклажка, а то, в свою очередь, восходит к слову «баклажка» — деревянной закрытой посудине, которую делали из обручей или долбили из цельного куска дерева. На Руси такие баклажки брали с собой в дорогу: в них носили воду, вино или квас. Это была удобная и привычная утварь, без которой не обходился ни один крестьянин, ни торговец, ни странник.

Прозвище Баклажка, скорее всего, относилось к так называемым профессиональным именованиям. Оно могло указывать на человека, который делал баклажки — бондаря или мастера по деревянной посуде. Не исключён и второй вариант: так могли прозвать торговца, который возил и продавал такую утварь. В русской ономастической традиции подобные прозвища часто закреплялись за родом занятий, а потом переходили в фамилию, вытесняя прежнее родовое имя.

Фамилия образована по характерной для украинских и южнорусских фамилий модели с суффиксом -ко. Этот суффикс вносит уменьшительно-ласкательный или обиходный оттенок, но в фамилиях он чаще всего выполняет словообразовательную роль, превращая прозвище в наследственное имя. Аналогов много: Бочка — Бочко, Ложка — Ложко, Баклага — Баклажко. В данном случае исходная форма — Баклажка, а фамильное окончание -о закрепилось в документах.

Интересно, что слово «баклажка» — уменьшительное от «баклага». Сама баклага была известна ещё в древнерусском языке, а фамилии от этой основы встречаются в разных вариантах: Баклагин, Баклаков, Баклаженко. Вариант Баклажко географически тяготеет к югу России и востоку Украины — регионам, где в фамилиях часто сохранялась именно такая суффиксальная модель.

Со временем прозвище Баклажка, которое сначала могли дать как дополнительное, прижилось и полностью заменило прежнее наследственное имя. В официальных записях — ревизских сказках, метрических книгах — оно закрепилось в форме Баклажко, и уже в таком виде передавалось из поколения в поколение. Никаких следов дворянского или иного привилегированного происхождения у этой фамилии нет: её носители — выходцы из крестьянской или ремесленной среды, люди, чей труд был связан с простым, но необходимым ремеслом.