Фамилия Балабеков — типичный пример восточной модели образования фамилий, где к основе, восходящей к личному имени, добавлен русский патронимический суффикс -ов. В данном случае основа — составное тюркское имя Балабек.

Имя Балабек, как и сама фамилия, двукоренное. Первая часть, «бал», восходит к казахскому языку и означает «дитя, сын, чадо». Вторая часть — «бек» — древнетюркский титул, который в переводе на русский язык передаётся как «князь, повелитель, начальник, господин». Таким образом, имя Балабек буквально означает «сын бека» или «княжич». Вполне возможно, что родители, нарекая ребёнка этим именем, желали ему высокого положения в обществе или же подчёркивали его происхождение от знатного рода.

Фамилия Балабеков образована по типичной для русской ономастики модели: к основе (имени Балабек) добавляется суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Балабеков, то есть сын Балабека). Такая модель была особенно распространена при русификации фамилий народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии. Благодаря суффиксу -ов фамилия легко вписалась в русскую грамматическую систему, сохранив при этом свою тюркскую основу.

С точки зрения географии, фамилия Балабеков наиболее характерна для регионов, где исторически тесно переплетались тюркские и славянские культуры: это Северный Кавказ (особенно Дагестан, где имя Балабек встречается у кумыков), а также Казахстан и Азербайджан. Значение фамилии прямо указывает на социальный статус предка — скорее всего, он был сыном уважаемого человека, носившего титул «бек».