Фамилия Балагун — редкий случай, когда прозвище почти наверняка перешло в фамилию без изменений, без суффиксов -ов или -ин. Её основа — слово «балагун», которое в южнорусских и украинских говорах означало «балагур», «шутник», «весельчак», «говорун». Человек с таким прозвищем был заводилой, любил посмешить народ, рассказывал байки — отсюда и пошло.

Модель образования проста и архаична: прозвище стало фамилией напрямую. Такое часто встречается на Украине, в Белоруссии и на юге России, где «усечённые» фамилии без патронимических суффиксов — не редкость. Если бы фамилия оформлялась по великорусской модели, мы бы имели Балагунова или Балагунина, но здесь — чистое прозвище, закреплённое в документах.

Есть и другая, менее вероятная версия: от тюркского слова «бала» (ребёнок, дитя) с добавлением аффикса -гун. В таком случае Балагун могло означать «сынок», «малыш», но это скорее гипотеза, чем установленный факт. Более надёжным остаётся славянский корень, связанный с говорливостью и юмором.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «балагун» имело ироничный оттенок — пустой болтун. Поэтому прозвище могло быть не только ласковым, но и насмешливым. Носитель фамилии мог происходить из крестьянской или казачьей среды, где такие «уличные» имена были особенно живучи.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, хотя встречается и в других регионах. В современных справочниках она нечастотна, что делает её ценной для семейной истории — найти однокоренные прозвища или фамилии (Балагура, Балагур) можно, но Балагун стоит особняком.