Фамилия Балахматова — женская форма фамилии Балахматов. В основе фамилии лежит редкое прозвище или неканоническое имя Балахмат. Скорее всего, оно образовано от двух корней: тюркского «бала» (ребёнок, дитя) и русского «хмат» — диалектного варианта слова «хмыль» (хитрый, плутоватый человек) или «хмурый». В таком случае Балахматом могли прозвать не по годам серьёзного или, наоборот, смышлёного мальчика.

Возможна и другая версия: «балахмат» — искажённое «балахман», что в некоторых говорах означало «бестолковый, рассеянный человек». Однако эта гипотеза менее убедительна, так как не подкреплена устойчивой лексической параллелью в словарях русских говоров.

Суффикс -ов в основе Балахматов указывает на типичную для XVI–XVII веков модель образования русских фамилий от прозвищ: «чей?» → Балахматов, то есть сын Балахмата. Фамилия встречается преимущественно в Поволжье — в Татарстане, Самарской и Ульяновской областях, что косвенно подтверждает тюркский след в первой части слова.

Стоит обратить внимание на ударение: в большинстве говоров оно падает на второй слог — Балахма́това, но в некоторых регионах (особенно среди потомков старообрядцев) можно услышать Балахмато́ва. Такая вариативность — дополнительный маркер локальной истории семьи.

В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется в разных написаниях: Балахматов, Балахматовъ, изредка Болохматов. Последний вариант мог возникнуть под влиянием аканья или путаницы с фамилией Болохматов, образованной от названия города Болохова. Но для Балахматовых связь с географическим названием маловероятна — корень явно прозвищный, а не топонимический.