Фамилия Балахнева образована от прозвища Балахон. Оно ведет свое начало от существительного «балахон», имеющего значение «старинная крестьянская верхняя одежда свободного покроя из холста, парусины и т.п.». Вероятно, прозвище Балахон содержало указание как на социальное положение основателя фамилии Балахнева: он был крестьянином. В таком случае Балахоном могли называть дровосека либо невнимательного человека. Согласно другой гипотезе, прозвище Балахон восходит к топониму Балахна — город в Нижегородской области на реке Волга.