Фамилия Балахно звучит на южнорусский или украинский лад и образована по модели, типичной для восточнославянских прозвищ. В её основе лежит слово «балах», которое в диалектах имело несколько значений. Самое вероятное — «балах» как «балахон», то есть просторная верхняя одежда, рабочий халат или мешковина. В таком случае прозвище Балахно могли дать человеку, который постоянно носил мешковатую, не по фигуре одежду, либо тому, кто шил или торговал такой одеждой. Суффикс -но в украинской и белорусской традиции часто придаёт прозвищу оттенок пренебрежения или шутливой характеристики — как, например, в фамилиях Лихо, Голо, Шило.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «балахом» называли пустомелю, болтуна или хвастуна. Корень «бала-» (от «балакать», «балаболить») дал множество фамилий: Балакин, Балашов, Балахнин. Балахно в этом ряду могло означать «говорун» или «тот, кто мелет языком». Однако такая трактовка слабее: суффикс -но реже встречается в прозвищах по характеру, чаще — по внешнему признаку.

Географически фамилия Балахно распространена в основном на Украине, особенно в центральных и восточных областях, а также в приграничных регионах России. Встречается и в Беларуси. По данным переписей, она не входит в число частых — это редкая фамилия, что говорит о её локальном происхождении, возможно, из одного села или хутора, где прозвище закрепилось за родом.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, Балахно не склонялась по падежам в мужском роде и не имела притяжательного суффикса — это указывает на то, что её носитель, скорее всего, был не крепостным, а казаком или свободным крестьянином, у которого прозвище сразу стало родовым именем. Если искать аналоги, то фамилия Балахно стоит в одном ряду с такими, как Балахон, Балахнин, но отличается именно украинским суффиксом, который делает её звучание более характерным для юга.