Фамилия Балахнины (в документах чаще встречается в форме Балахнин) — это типичная русская фамилия, образованная от личного прозвища. Её основа — слово «балахна», которое в разных регионах имело совершенно разный смысл. В нижегородских говорах так называли меру дров на солеварнях (варницах): 10 аршинов в длину и 3 в высоту при полене в аршин. Во владимирских — просторную, мешковатую одежду, балахон. А в переносном, народном значении балахной называли разиню, неряху или небрежного человека. Отсюда и три главные версии происхождения прозвища: предок Балахниных мог работать на варнице, принимать и учитывать дрова; мог быть портным, который шил крестьянские балахоны; или же получил прозвище за нерасторопность и неопрятность.

Поскольку фамилия заканчивается на -ин, а не на -ов, она указывает на прямое родство: Балахнин — это буквально «сын Балахны» или «человек из дома Балахны». Такая патронимическая модель была особенно распространена в северных и центральных русских землях. Связь с городом Балахна (Нижегородская область) возможна, но необязательна: название города того же корня («балахна» — «открытое место, ротозей»), и фамилия могла возникнуть независимо от топонима.

Слово «балахон» в значении «широкая одежда» в старину имело и ироничный оттенок — «ворота, одежда или рот настежь». Поэтому прозвище Балахна чаще всего давали с долей насмешки, подмечая либо внешнюю небрежность, либо дурную привычку человека. Сейчас фамилия Балахнин встречается нечасто, но сохраняет память о старом быте, солеварном промысле и народном чувстве юмора.