Фамилия Балханов — один из тех случаев, где за простым звучанием скрывается сразу несколько версий, и выбрать единственную непросто. Самая очевидная и лингвистически прозрачная отсылает к слову «балахна» — в старых русских говорах так говорили о распахнутых воротах, одежде нараспашку или широко открытом рте. Прозвище Балахна могли дать человеку неряшливому, невнимательному, вечно расхристанному. Фамилия Балханов, скорее всего, образовалась от той же основы через форму Балахан (с характерным чередованием гласных и упрощением).

Однако слово «балахна» звучит почти как название города Балахна в Нижегородской области. Если предок носителя фамилии был оттуда родом, прозвище могло указывать на место жительства, а не на черту характера. В ономастике такие случаи — географические прозвища — встречаются сплошь и рядом.

Есть и тюркский след. Слово «балахон» (или «балахан») в ряде тюркских языков означало просторный халат, верхнюю одежду. Эта версия менее правдоподобна для исконно русской фамилии, но полностью исключать её нельзя: фамилия могла возникнуть на стыке культур, например, в смешанных регионах Поволжья.

Сама модель образования — на -ов — типична для русских фамилий, возникших из прозвищ или мирских имён. Суффикс указывает на принадлежность: «сын Балахана». Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, имеют корни в центральной России или Поволжье, где и бытовало слово «балахна».