Фамилия Балхановский — одна из тех, где прозрачная основа обманчива, а суффикс указывает на точный социальный срез. Первое, что бросается в глаза: окончание -ский. В русской ономастике это маркер либо польского (шляхетского) происхождения, либо, что чаще, русской семинарской или духовной среды. Фамилии на -ский в XIX веке массово давали выпускникам духовных училищ и семинарий, часто искусственно, от названий мест или приходов. Поэтому Балхановский мог появиться не как наследное родовое прозвище, а как «учёная» фамилия, присвоенная ученику.

Основа «Балхан» отсылает к тюркскому слову «балхан» — так в ряде языков (казахском, туркменском, каракалпакском) называют глиняный обрыв, яр, холм или возвышенность. В топонимике это слово известно: есть, например, Большой и Малый Балхан в Туркменистане, а также ряд урочищ в Поволжье и Казахстане. Если фамилия образована от названия места, то предок носителя мог быть выходцем из села или хутора Балхан (или Балханы). Такие топонимические фамилии на -ский особенно типичны для южнорусских и украинских земель, где смешивались славянские и тюркские названия.

Менее вероятная, но возможная версия — от прозвища Балхан. В диалектах русского юга «балхан» иногда означало «болтун, пустомеля» (от глагола «балханить» — говорить вздор). В этом случае фамилия была бы чисто прозвищной, но модель -ский для прямых прозвищ нехарактерна: крестьянину или ремесленнику дали бы Балханов или Балханин, а не Балхановский. Поэтому версия с искусственным образованием от географического названия выглядит убедительнее.

Интересно, что фамилия редкая и не встречается в старых боярских или дворянских списках. Её носители — почти наверняка потомки духовенства или, реже, выходцы из западнорусских земель, где -ский было универсальным окончанием для фамилий любого сословия. В современных базах данных Балхановские сконцентрированы в основном на юге России и в Казахстане, что косвенно подтверждает связь с тюркским топонимом.