Фамилия Балковые — редкий пример, когда окончание -ые сразу указывает на форму множественного числа. Это характерный признак северных и сибирских фамилий, возникших в среде крестьянства и служилых людей. Такие фамилии отвечали на вопрос «чьи?» и обозначали принадлежность целому роду: Балковые — то есть «дети, потомки Балка». В центральных и южных губерниях России та же фамилия закрепилась бы в форме Балковы.

Основа фамилии — прозвище или некалендарное имя Балок. В русских говорах слово «балка» имело два основных значения: овраг, лощина с пологими склонами, и брус, перекладина. Прозвище Балок мог получить человек, живший у оврага или на пересечённой местности, либо, что менее вероятно, плотник или строитель, работавший с балками. В пользу первой версии говорит распространённость топонимических прозвищ в крестьянской среде: людей часто называли по месту жительства — Заречный, Горный, Луговой.

Суффикс -ок в основе Балок указывает на уменьшительную форму. В XVI–XVII веках так могли называть младшего в семье или сына того, кого звали Балка. Полная форма Балка тоже встречалась как прозвище — от того же корня. Ономастика фиксирует фамилию Балков в документах XVII века в Поморье и на Урале, что подтверждает северное происхождение модели Балковые.

Встречается и другая, менее правдоподобная версия: связь с тюркским «балык» — рыба. Но для фамилии Балковые, а не Балыковы, такое объяснение выглядит натяжкой. Фонетически русское «балка» и тюркское «балык» не смешивались в народной речи, и фамилия явно сложилась на русской почве.

Таким образом, Балковые — это потомки человека по прозвищу Балок, скорее всего жившего у оврага или балки. Фамилия закрепилась в форме множественного числа, типичной для северных областей России, и сохранила память о географическом ориентире, по которому предки отличали свою семью среди соседей.