Фамилия Балота — редкий случай, когда суффикс не даёт подсказки о происхождении. В ней нет типичных русских окончаний -ов, -ин, -ский. Это значит, что фамилия либо пришла из другой языковой среды, либо образована напрямую от прозвища без дополнительного оформления. Скорее всего, перед нами украинская, белорусская или польская фамилия, где форма на -а характерна для существительных мужского рода.

Корень «балот» прямо указывает на слово «болото». В украинском и белорусском языках «балота» — это и есть болото. Прозвище Балота могли дать человеку, который жил возле топкого места, на болотистой почве. Такие прозвища по ландшафту — одни из самых древних: они не требовали специального повода и закреплялись за целыми семьями. Вторая версия, менее вероятная, — связь с диалектным глаголом «балотить» (качать, болтать), но она не подтверждается массовым бытованием фамилии.

Словообразовательная модель проста: основа «балот» + окончание -а. В восточнославянской традиции так оформлялись прозвища, которые потом становились фамилиями без изменений. Встречается и вариант с суффиксом: Балотов (тот же корень, но уже с русским -ов). Балота — более архаичная, «неоглядная» форма, которая сохранилась в западных регионах бывшей Речи Посполитой.

Географически фамилия тяготеет к Полесью — исторической области на границе Украины и Беларуси, где болота — часть повседневного пейзажа. Там она могла возникнуть независимо в нескольких сёлах. В России носители Балота встречаются редко, чаще как следствие миграции из западных губерний в XIX — начале XX века.

Социальный контекст прост: фамилия недворянская, крестьянская или мещанская. Владельца земли так бы не назвали — болото считалось неудобьем. Зато для крестьянина, чей надел граничил с топью, такое прозвище было точным адресом.