Фамилия Балтаров образована от тюркского имени Балтар, которое восходит к двум корням: «бал» — «мёд, сладость» и «тар» — «дар, подарок». Таким образом, в основе прозвища или имени лежит значение «сладкий дар», «медовый подарок». В тюркской ономастике такие составные имена с элементом «бал» нередки — они несли пожелание ребёнку сладкой, благополучной жизни.

Модель фамилии — патронимическая, на -ов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Балтаров буквально значит «сын Балтара». Эта модель типична для русских фамилий, образованных от тюркских имён, особенно в Поволжье, на Урале и в Сибири, где русское население веками соседствовало с татарами, башкирами и другими тюркскими народами.

Встречается фамилия и в среде бурят, калмыков, а также у народов Северного Кавказа, где имя Балтар могло быть вариантом местных имён. Например, у бурят «балта» означает «молот», и здесь возможна вторичная версия: прозвище Балтар — «кузнец» или «сильный, как молот». Однако первая версия, с «медовым даром», надёжнее подкреплена тюркской антропонимией.

Однокоренные фамилии — Балтаев, Балташев, Балтабаев. Все они отталкиваются от общей основы «балта», но с разными суффиксами и окончаниями, что указывает на разные регионы и языковые традиции. Балтаров — одна из самых распространённых форм, особенно в Татарстане и Башкортостане.

Сословно фамилия не была привязана к знати: Балтаровы могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками. В документах XVIII–XIX веков носители фамилии встречаются среди государственных крестьян Казанской губернии и среди оренбургских казаков.