Фамилия Балташов образована от тюркского имени Балташ. В основе лежит слово «балта» — «топор». В тюркских языках имена с таким корнем давали мальчикам как оберег: считалось, что имя, означающее твёрдый, рубящий предмет, передаст ребёнку силу и защитит от зла. Форма Балташ — это уменьшительно-ласкательный вариант, буквально «топорик». Русский суффикс -ов превратил отчество в фамилию: Балташов значит «сын Балташа».

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками соседствовали русские и тюркские народы. Наибольшая концентрация Балташовых зафиксирована в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Это типичная «встречная» фамилия: тюркское имя попало в русскую ономастику через крещёных татар, башкир или чувашей, которые при переходе в православие получали фамилии по отцу. В XIX веке многие носители фамилии числились государственными крестьянами или однодворцами.

Интересная деталь: фамилия Балташов — редкий случай, когда тюркская основа сохранила не усечённую, а полную уменьшительную форму. Сравните с однокоренными Балтаев, Балтин или Балтаков — там корень «балта» часто обрублен или усложнён другим аффиксом. У Балташова суффикс -аш ясно указывает на ласкательное прозвище, что делает фамилию более «домашней» по происхождению.

Других версий, кроме тюркской, у фамилии нет. Славянское слово «балта» в значении «болото» существует в диалектах, но оно никогда не давало личных имён — только топонимы. Поэтому связывать Балташова с болотистой местностью ошибочно.