Фамилия Балтрушин — редкий случай, когда на слух она кажется славянской, а по корню оказывается прибалтийской. В основе лежит литовское или латышское личное имя Балтруша — разговорная форма крестильного имени Бальтазар. В балтийских языках оно звучало как Baltrušis или Baltruša, а русская среда добавила к нему типичный фамильный суффикс принадлежности -ин. Получается: Балтрушин — «сын Балтруши» или «человек из рода Балтрусов».

Сам корень «Балт-» в балтийских именах обычно восходит к слову baltas — «белый». В имени Бальтазар (библейского происхождения, от аккадского «Бел-шар-уцур» — «Бел защити царя») в народной этимологии его переосмыслили как «белый царь» или «белый князь». Но в быту сложную форму сократили до простого Балтруша, а от неё уже пошли фамилии.

Географически фамилия привязана к западным регионам России и Беларуси, где исторически жили литовцы и латыши, а также к польско-литовскому пограничью. Встречается в Псковской, Смоленской областях, в Литве и Латвии — но в русифицированном варианте с окончанием -ин, а не с балтийским -ис.

Интересная деталь: фамилия Балтрушин могла возникнуть не от прямого имени, а от прозвища Балтруш — так русские соседи могли называть литовца или латыша, выделяя его по языку или происхождению. В польском языке есть схожая фамилия Bałtruszyński, но суффикс -ин указывает именно на русскую или белорусскую почву.

Сословно предки Балтрушиных могли быть крестьянами или мещанами — фамилия не знатная, без дворянских суффиксов -ский/-цкий. Однако в Литве и на Смоленщине встречаются и шляхетские роды с похожей основой, но там окончание было бы -евич или -ский. Так что Балтрушин — фамилия демократичная, народная, возникшая в среде, где литовское имя приспособили к русскому быту.