Фамилия Балышкановы образована от прозвища или нецерковного имени Балышкан. В её основе лежит тюркский корень, что сразу указывает на восточное происхождение родоначальника. Сама фамилия — это типичная русская патронимическая модель: суффикс -ов присоединился к основе, чтобы указать на принадлежность («чей?» — Балышканов), то есть «сын Балышкана».

Над значением исходного прозвища Балышкан лингвисты спорят. Есть две основные версии, и одна из них заметно правдоподобнее. Первая, более слабая, связывает прозвище с тюркским словом «балаш» — «дитятко, сыночек». В таком случае Балышкан — это ласкательное именование младшего в семье или просто ребёнка.

Вторая версия сложнее и убедительнее. Она разбивает прозвище на две турецкие основы: «bal» (мёд) и «ask» (любовь). Буквально — «медовая любовь» или «сладкая любовь». Однако в бытовом, а не поэтическом смысле такое прозвище могли дать человеку за его заметную любовь к мёду и сладостям, то есть попросту сладкоежке. Эта версия выглядит предпочтительнее, поскольку называние человека по его вкусовым пристрастиям — распространённый приём в народной антропонимии.

Говорить о точном времени и месте возникновения фамилии Балышкановы сложно: процесс становления русских фамилий, особенно с иноязычной основой, был долгим и не всегда документирован. Ясно одно: фамилия закрепилась в среде, где тюркские прозвища адаптировались под русскую грамматику с помощью суффикса -ов. Встречающееся написание через «а» (Балашканов) — вариант, возникший из-за акающего произношения, когда безударный звук на письме передаётся по-разному. Сама фамилия остаётся живым следом контакта славянской и тюркской культур, а её основа хранит память о прозвище, которое когда-то дали предку.