Фамилия Барботин — редкая, но с прозрачной внутренней формой. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Барбота. В русских говорах, особенно южных и западных, «барботать» означало «бормотать, ворчать, говорить невнятно». Человек с таким прозвищем, скорее всего, отличался негромкой, быстрой речью или имел привычку что-то бормотать себе под нос. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Барботин — «сын Барботы» или «человек из семьи Барботы».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «барбота» в значении «суета, хлопоты, беспокойство». Тогда прозвище мог получить суетливый, хлопотливый человек. Оба варианта укладываются в модель, по которой русские фамилии образовывали от бытовых прозвищ, характеризующих поведение или характер.

Словообразовательная модель проста: основа Барбот- плюс типичный русский патронимический суффикс -ин. Фамилия не имеет дворянских или книжных корней — она крестьянская или мещанская по происхождению. Географически фамилия встречается разрозненно, без ярко выраженного гнезда, что говорит о её спорадическом возникновении в разных местах. В дореволюционных записях её можно встретить в Курской, Воронежской и Тульской губерниях.

Примечательно, что фамилия Барботин не имеет ничего общего с итальянской «барба» (борода) или французским «барбот» — это чисто славянская, звукоподражательная основа. В отличие от более распространённых Барабановых или Бормотиных, Барботин сохранил редкую огласовку корня, что делает его ценным для диалектологов: слово «барботать» сейчас почти вышло из употребления и осталось только в фамилиях и некоторых говорах.