Фамилия Барготин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа Баргот- не встречается в списке распространённых русских имён или прозвищ, поэтому здесь возможны две основные версии, и обе заслуживают внимания.

Первая версия связывает фамилию с профессиональным прозвищем. В русских говорах слово «баргота» могло означать болтуна, пустомелю или человека, который говорит невнятно, бормочет. Глагол «барготать» в некоторых диалектах имел значение «болтать вздор», «говорить быстро и неразборчиво». Если принять эту гипотезу, то Баргота — прозвище говорливого или не слишком внятного в речи человека, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Барготы». Модель образования типична для русских фамилий — от прозвища на -а с помощью -ин.

Вторая версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта: например, деревни Барготино или Барготы. Такие топонимы встречаются в центральных и северных областях России, хотя и крайне редко. В этом случае Барготин — это «выходец из Баргот», а суффикс -ин выполняет ту же притяжательную функцию, что и в первой версии. Склоняемся к тому, что прозвищное происхождение более вероятно: фамилии от названий деревень обычно оформляются через -ский/-ской (Барготинский), а форма на -ин характерна именно для прозвищ.

Суффикс -ин в фамилии Барготин указывает на её древность и принадлежность к севернорусскому или центральнорусскому ареалу. Такие фамилии чаще всего встречались в крестьянской и мещанской среде, реже — среди духовенства. Дворянских родов с этой фамилией в исторических документах не зафиксировано.

Однокоренных фамилий немного: Барготкин, Барготский. Все они объединены общей диалектной основой, что подтверждает её народное, неиноязычное происхождение. Искусственное или книжное происхождение маловероятно — фамилия не связана с церковными именами или географическими названиями из других языков.

Таким образом, Барготин — относительно редкая русская фамилия, образованная от прозвища Баргота (болтун, говорун) с помощью патронимического суффикса -ин, и уходит корнями в диалектную лексику северных и центральных областей России.