Фамилия Барбухин — редкий случай, когда суффикс указывает на географию точнее, чем корень. Модель образования проста: основа «Барбух» плюс типичный русский патронимический суффикс -ин, означающий «чей?», «сын кого?». Поэтому Барбухин — буквально «сын Барбуха». А вот откуда взялось прозвище Барбух, тут начинается самое интересное.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «барбуха» или «барбух» — так в южнорусских и украинских говорах называли барсука. Прозвище Барбух могли дать человеку по внешнему сходству (коренастый, неуклюжий, с широкими скулами) или по черте характера (скрытный, домовитый, любящий уединение). В пользу этого говорит и то, что в русских фамилиях зооморфные прозвища — огромный пласт: Волков, Зайцев, Медведев. Барсук — животное не самое распространённое в центральной России, но в черноземье и на юге его знали хорошо, что и даёт региональную привязку.

Менее правдоподобная, но упоминаемая в любительских словарях версия — от тюркского слова «барбух», означающего что-то вроде «пёстрый» или «рябой». Однако в тюркских языках такого корня с чётким значением не зафиксировано, и эта гипотеза выглядит натянутой. Более того, суффикс -ин, а не -ов, типичен для фамилий, образованных от прозвищ на мягкий согласный или -а/-я, что как раз подходит под форму «Барбуха».

Сравнение с однокоренными фамилиями — Барсуков, Барсученко, Барсучин — показывает, что Барбухин стоит в том же ряду, но с другой диалектной основой. Если Барсуков встречается повсеместно, то Барбухин — более локальная форма, скорее всего, из Курской, Воронежской или Ростовской областей, где слово «барбуха» было в ходу. Социальный контекст ясен: прозвища давали крестьянам, реже — посадским людям, так что предки Барбухиных были, скорее всего, сельскими жителями. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её народное, «прозвищное» происхождение.