Фамилия Бабухина — женская форма фамилии Бабухин, и её происхождение стоит искать в прозвище, а не в родстве со словом «бабушка». Основа здесь — «бабуха», но не в значении «старуха», а в старом русском диалектном слове, которое в разных говорах означало либо «большой хлеб», либо «толстая, неуклюжая женщина». Скорее всего, прозвище Бабуха давали человеку крупного телосложения, упитанному и медлительному, или же тому, кто пёк караваи — «бабухи».

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Бабухин — это «сын Бабухи» или «человек из рода Бабухи». Фамилии на -ин в русском языке типичны для прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от мужских имён на твёрдый согласный, Бабухин стоит в ряду таких же «материнских» или прозвищных фамилий, как Воронин, Птицын, Галкин.

Интересно, что фамилия Бабухин (а значит, и Бабухина) не слишком распространена. Она встречается в центральных областях России, особенно в бывших Владимирской и Костромской губерниях, где диалектное слово «бабуха» было в ходу. В XIX веке её носили в основном крестьяне и мещане, что подтверждает прозвищное, а не боярское происхождение.

Есть и редкая версия, что прозвище могло возникнуть от «бабук» — так в некоторых говорах называли гриб-дождевик. Тогда носитель прозвища получал его за округлую форму или за то, что «лопался» при ходьбе, как гриб. Но эта гипотеза менее убедительна: «бабук» — слово локальное и редкое, а «бабуха» как обозначение чего-то большого встречается шире.

Таким образом, фамилия Бабухина — это отсылка к внешности или роду занятий предка, который, вероятно, выделялся дородностью или пёк хлеб. Никакой связи с бабушками-старушками здесь нет, что часто удивляет носителей фамилии.