Фамилия Батюков образована от прозвища Батя. В разных говорах у этого слова были свои оттенки: в рязанском диалекте батей называли уважаемого, мудрого старика, в сибирских — отца, брата, приятеля или товарища. Поэтому прозвище мог получить как глава семьи, так и просто близкий человек в окружении. Фамилии на -ов, образованные от слов родства, в русской ономастике встречаются часто — достаточно вспомнить Дедова или Братищева.

Но у фамилии Батюков есть и вторая, не менее правдоподобная версия. Слово «батя» в народной среде могло быть обращением к батюшке, то есть к священнику. В таком случае фамилия указывает не на родство, а на занятие предка — служителя церкви. Интересно, что суффикс -юк- (в форме Батюк) характерен для украинской и белорусской традиции, а уже на русской почве его переоформили в стандартное Батюков. Это говорит о возможных западнорусских корнях рода: предки могли прийти из Белоруссии или с Украины, где прозвище Батюк было более употребительным.