В его основе лежит слово «байбарак», которое имеет значение «плотная шелковая и парчовая ткань», а в новороссийских говорах так называли женскую праздничную шубу. Вполне вероятно, что основатель рода Байбара либо торговал дорогими и редкими тканями, либо был портным. Маловероятной представляется другая гипотеза: фамилия Байбара имеет восточное происхождение. Первая ее часть образована от тюркского слова «бай» — «богач, хозяин, господин». Относительно второй части фамилии существует несколько версий. «Бара» может быть усеченным татарским наречием «бара-бара» — «постепенно, с течением времени», или краткой формой одного из мусульманских мужских имен: Барай («молодой месяц; начало месяца»), Бари («создатель, творец»).