Фамилия Байбульдин — редкий образец русской фамилии, образованной от тюркского составного имени. Её основа — мужское имя Байбульда, распространённое у башкир, татар и казахов. Первая часть «бай» в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин», вторая — «бульда» восходит к глаголу со значением «стал», «сделался». В сумме имя Байбульда можно перевести как «ставший богатым», «разбогатевший» или «сделавшийся господином». Такие имена-пожелания давали мальчикам в надежде на благополучную и обеспеченную жизнь.

Суффикс -ин указывает на русскую модель образования фамилий от основ, оканчивающихся на -а или -я: Байбульда → Байбульдин, то есть «сын (или потомок) Байбульды». Это типичный патроним, который закрепился в русской среде при оформлении фамилий у крещёных татар и башкир в XVI–XIX веках. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые преобладают у русских, -ин чаще встречается именно в семьях тюркского происхождения, принявших православие.

Географически фамилия Байбульдин привязана преимущественно к Оренбургской области, Башкортостану и Татарстану. Встречается она и в Казахстане, но реже. Носители фамилии — потомки тех, кто входил в состав тептярей или башкирских родов, переходивших на оседлый образ жизни и получавших русские фамилии при переписях. Сословно это были в основном государственные крестьяне, реже — казаки.

Ономастический словарь Б. Унбегауна не упоминает эту фамилию прямо, но её модель полностью соответствует описанной им схеме образования русских фамилий от тюркских основ с суффиксом -ин. Споров о происхождении корня практически нет: тюркская этимология очевидна, а русский суффикс — вопрос времени и административной адаптации.

Любопытная деталь: в некоторых документах XVIII века встречается написание «Байбулдин» — с одной буквой «д». Это не ошибка переписчика, а следствие акающего произношения в говорах Оренбуржья, где безударное «о» в суффиксе могло заменяться на «а», а двойное «д» — упрощаться. Современное написание с двумя «д» закрепилось позже, уже в советских паспортах.