Фамилия Баймульдин — одна из тех, что с первого взгляда выдают свою сложную составную природу. Её основа — восточное имя Баймульда, которое представляет собой сжатый вариант более полного имени Баймульдин. Разбор по частям даёт ключ к пониманию того, что предки носителя этой фамилии ценили и каким видели человека.

Имя Баймульдин, а значит и фамилия, складывается из трёх компонентов. Первый — тюркское «бай», то есть «богатый, зажиточный, хозяин». Второй — «мулла» (от тюркского mella), что означает не просто духовный сан, а образованного человека, учителя, наставника и проповедника. Третий — арабское «дин» — «вера, религия». Таким образом, имя Баймульдин можно истолковать как «богатый верой мулла» или «обладающий богатством веры и знания». Имя не просто хвалило человека, а задавало высокую планку: сочетание материального достатка («бай») и духовного авторитета («мулла») считалось идеальным.

Фамилия образована по типичной для тюркских народов модели: к основе имени Баймульда добавили русский патронимический суффикс -ин. Такой способ был распространён в среде казахов и других народов, входивших в состав Российской империи, когда при переписях и оформлении документов к тюркским именам механически прикрепляли русские окончания. В документах начала XX века фамилия уже встречается в закреплённом виде. Например, известно о Баймульдине Джумабеке Баймульдиновиче, родившемся в 1901 году в Восточно-Казахстанской области. Эта запись — прямое свидетельство, что фамилия бытовала на востоке современного Казахстана, в регионе, где веками смешивались тюркские и мусульманские традиции.

География фамилии довольно узкая. Баймульдины — это в основном казахи, и корни фамилии уходят в те места, где кочевой быт соседствовал с исламской учёностью. Предок, получивший такое имя, скорее всего, происходил из семьи, где уважали и скот, и грамоту: «бай» мог указывать на состоятельного скотовода, а «мулла» — на человека, обучавшего детей Корану и письму. Не стоит искать в фамилии указание на конкретное ремесло или сословие — она скорее описывает идеальный образ, пожелание, заложенное в имя при рождении.