Фамилия Баймулдин — одна из тех, что сразу выдают тюркское происхождение. Её основа — составное мужское имя Баймулда, которое в переводе с казахского или татарского означает «богатый мулла» или «состоятельный учёный» (бай — «богатый, хозяин», мулла — «исламский священнослужитель, грамотей»). Так могли прозвать либо действительно зажиточного и влиятельного муллу, либо человека, который вёл себя важно и степенно, как духовное лицо. В народе такие прозвища давали не только по профессии, но и по характеру.

Русский суффикс -ин добавляется к основам, оканчивающимся на -а, -я. Здесь он работает по стандартной модели «имя + -ин»: Баймулда → Баймулдин, то есть «сын Баймулды» или «из рода Баймулды». Такая форма характерна для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир или казахов, которые входили в состав Российской империи. Обратите внимание: окончание -дин, а не -дов — это верный признак того, что фамилию дали от имени с конечной гласной, а не от прозвища на согласный.

Географически фамилия Баймулдин чаще всего встречается в Оренбургской области, Башкортостане, Татарстане и в северо-западных регионах Казахстана. В XIX веке носители этой фамилии были в основном государственными крестьянами или казаками — людьми, которые несли службу на границе и платили ясак. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано: она осталась в простонародной среде.

Любопытно, что имя Баймулда — не чисто религиозное, а бытовое. В тюркской ономастике «мулла» могло означать просто грамотного человека, умеющего читать и писать. Поэтому предок носителя фамилии мог быть не священником, а сельским писарем, учителем при мечети или даже вольнодумцем, которого в шутку величали «муллой» за любовь к книгам.