Фамилия Байдали — одна из тех, где корень яснее всего прочитывается в тюркских языках. В основе лежит имя или прозвище Байдалы, которое состоит из двух частей: «бай» (богатый, знатный, господин) и «далы» (плечо, опора, сила). В буквальном смысле Байдалы — «богатырское плечо», «надёжная опора». Такие составные имена были распространены у казахов, татар, башкир и других тюркских народов: ими подчёркивали силу, состоятельность или покровительство.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -и, который в данном случае заменяет тюркское окончание. Встречается она преимущественно у потомков татарских мурз, башкирских старшин или казахов, перешедших в русское подданство и получивших фамилию по имени родоначальника. В русской среде фамилия редкая, её носители сосредоточены в Поволжье, на Южном Урале и в Западной Сибири — именно там, где исторически плотно селились тюркские народы.

Стоит отметить, что в некоторых диалектах «далы» могло означать не только плечо, но и «жеребёнок» или «детёныш». Тогда Байдалы — «богатый приплодом», что тоже звучит как пожелание достатка. Но первая версия — с опорой и силой — встречается в ономастических работах чаще и считается основной.

Есть и менее вероятная версия, что фамилия связана с арабским именем Байда (белый, ясный) с добавлением тюркского суффикса принадлежности. Однако в таком случае форма была бы Байдаев или Байдалин, а не Байдали. Поэтому тюркское сложение «бай + далы» остаётся самым убедительным объяснением.

В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксировалась в написании Байдалин — с двойным суффиксом, что типично для русификации: сначала тюркское -лы, затем русское -ин. Со временем окончание упростилось до современного Байдали, что встречается у многих фамилий тюркского происхождения.