Фамилия Байготов — редкая, но её происхождение довольно прозрачно. В её основе лежит тюркское мужское имя Байгот, которое состоит из двух частей: бай — «богатый, господин, хозяин» и гот (или кут) — «счастье, удача, благодать». Таким образом, имя Байгот буквально означало «богатое счастье» или «господин удачи». Имя было призвано привлечь своему носителю благополучие и успех. Фамилия образовалась по русской модели — с помощью притяжательного суффикса -ов, который отвечает на вопрос «чей?». Байготов — это «сын (или потомок) Байгота».

География фамилии указывает на её связь с Северным Кавказом и Поволжьем. Наибольшее распространение она имеет среди осетин, кабардинцев и балкарцев, а также встречается у башкир и татар. Это не случайно: имя Байгот и его варианты (Байгута, Байкут) были распространены в тюркоязычной и кавказской среде, где ценились имена-пожелания с корнем «бай». В русские метрические книги фамилия попала в XIX веке, когда крестьянам и горцам массово давали фамилии по отцу.

Интересная особенность — в фамилии сохранился архаичный тюркский компонент «гот», который в современных языках почти вышел из употребления. В осетинском языке, например, это слово трансформировалось в «худ» (счастье), а в татарском — в «кот». Поэтому фамилия Байготов — своего рода лингвистическая «окаменелость», зафиксировавшая более древнюю форму слова. Сравните с однокоренными фамилиями Байкулов или Байгушев — в них та же основа, но с другим суффиксом или огласовкой.

Кем были предки Байготовых? Скорее всего, это были люди, носившие имя Байгот как личное прозвище или имя, данное при рождении. Поскольку имя было пожелательным, его могли давать в семьях, где хотели подчеркнуть стремление к богатству и удаче. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и узденями (дворянами) у горских народов — точных данных нет, так как фамилия не принадлежала к титулованным родам. Версия о происхождении от названия ремесла или места здесь не работает: корень «гот» не связан ни с каким занятием, только с понятием счастья.