Фамилия Байсиев — редкая и неочевидная для русского уха. Чтобы понять её происхождение, нужно сразу отбросить привычную модель «от имени или прозвища + -ов/-ев». Суффикс -ев здесь указывает на патроним (отчество), но основа «Байси» не имеет очевидных славянских корней. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, адаптированная русским окончанием.

Наиболее правдоподобная версия связывает основу с тюркским словом «бай» (богатый, господин, хозяин) и суффиксом принадлежности «-сы/-си». В этом случае «Байси» означает «его бай» или «принадлежащий баю». Фамилия могла образоваться от личного имени Байсы (Байси), которое в тюркской ономастике давали ребёнку в знак уважения к богатому или влиятельному человеку, либо как пожелание богатства. Вторая часть могла восходить к тюркскому «сы» (вода, река) — тогда «Байсы» означало бы «богатая вода», что тоже возможно как прозвище по месту жительства у реки.

Географически фамилия Байсиев встречается преимущественно на Северном Кавказе, особенно среди осетин и ингушей, а также в среде тюркских народов — кумыков, балкарцев, карачаевцев. В русском контексте она могла появиться через межэтнические браки или при записи в документах в XIX — начале XX века, когда горцам и кочевникам давали фамилии по отцу. Форма с окончанием -ев типична для русификации нерусских фамилий: например, у осетин часто встречаются Байсиевы, Байсаевы, Байсултановы.

Вторая, менее вероятная версия — что фамилия восходит к арабскому имени Баис (посылающий, отправляющий) через тюркское посредничество. Но в таком случае ожидалась бы форма Байсов или Баисов, без характерного тюркского суффикса -си. Поэтому версия с «бай» и притяжательным аффиксом выглядит убедительнее. Как бы то ни было, предки первых Байсиев, скорее всего, были скотоводами, воинами или уважаемыми старейшинами в своих общинах, а сама фамилия несёт оттенок достатка и статуса.