Фамилия Байтюкова — женская форма редкой и неочевидной по происхождению фамилии Байтюков. Её основа — мужское личное имя или прозвище Байтюк, которое, скорее всего, имеет тюркские корни. В тюркских языках компонент «бай» означает «богатый», «господин», «хозяин», «уважаемый человек». Вторая часть — «тюк» — может восходить к тюркскому «тюк» (груз, ноша, связка) или к глаголу со значением «нагружать», «укладывать». Таким образом, Байтюк могло быть прозвищем зажиточного купца, человека, который «возит богатство», или же именем-пожеланием, данным ребёнку в надежде на его будущую состоятельность и весомость в обществе.

Менее вероятна, но допустима версия, связывающая фамилию с арабским именем Байтук (от «байт» — дом, жилище) через посредничество тюркских языков. В этом случае прозвище могло указывать на домовитого, хозяйственного человека или на того, кто строил дома.

Суффикс -ов в мужской форме указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Байтюков — буквально «сын (или потомок) Байтюка». Фамилия встречается в основном на юге России, в Поволжье и на Урале — в зонах активных контактов русского и тюркского населения. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания служилых людей и крестьян с похожими основами, но точная дата появления именно фамилии Байтюков не установлена.

Обратите внимание на орфографию: в современном русском языке фамилия пишется через «ю» (Байтюков), хотя в старых записях могла встречаться форма Байтюков или Байтюковъ. Вариант с «ё» (Байтёков) маловероятен, так как основа не связана с глаголом «тёк» или словом «тётя». Таким образом, корни фамилии — в прозвище, данном по достатку или хозяйственному укладу предка, жившего в зоне тюркско-славянского пограничья.