Фамилия Байтина — женская форма фамилии Байтин. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я, и указывают на принадлежность: «чей?» — Байтин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Байта.

Корень этой фамилии — неочевидный и редкий. Самое вероятное объяснение ведёт к тюркским языкам. В тюркских наречиях «бай» означает «богатый», «господин», «хозяин». Уменьшительно-ласкательная форма «Байта» могла быть прозвищем зажиточного крестьянина, купца или уважаемого человека. Такие прозвища давали не в насмешку, а по реальному положению дел: если человек владел скотом, землёй или вёл успешную торговлю, его могли называть Байтой.

Менее распространённая, но допустимая версия — происхождение от русского дохристианского имени Байта. В древнерусских говорах «баить» значит «говорить», «рассказывать». Байтой могли прозвать говорливого, красноречивого человека, сказителя или балагура. Однако эта версия слабее: фамилия Байтин встречается в основном в регионах, где исторически сильны тюркские влияния — в Поволжье, на Урале, в южных областях России. В чисто русских северных и центральных губерниях она редка, что склоняет чашу весов в пользу тюркского корня.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия сформировалась в среде простых людей, чаще всего крестьян или посадских, а не дворянства. Дворянские фамилии нередко имели суффиксы -ов/-ев при основах на согласный, а -ин в массе своей — удел «низового» населения. Это не делает фамилию малоинтересной: наоборот, она — маркер того, что предки носителя Байтина были людьми практичными, которых в быту называли по достатку или заметной черте.