Фамилия Бедирханлы — яркий пример того, как географическое и этническое происхождение напрямую закрепляется в родовом имени. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от имени или прозвища предка, эта фамилия указывает на конкретную местность, откуда был родом основатель рода. В основе лежит топоним Бедирханлы — название одного из азербайджанских сёл или населённых пунктов, которых несколько в разных регионах Азербайджана (например, в Геранбойском или Лачинском районах). Суффикс -лы (или -ли) в тюркских языках, в том числе азербайджанском, является патронимическим и означает «относящийся к», «происходящий из». Таким образом, Бедирханлы — это «тот, кто из Бедирхана», «выходец из села Бедирханлы».

Сама основа Бедирхан — это сложносоставное имя или прозвище. Первая часть, «Бедир», восходит к арабскому слову «бадр» — «полная луна», которое в мусульманском именослове часто используется как компонент имени (например, Бедреддин — «полнота веры»). Вторая часть, «хан», — тюркский титул, означающий правителя, владыку. Вместе Бедирхан можно перевести как «хан, подобный полной луне» или «светлый, сияющий хан». Скорее всего, это было личное имя основателя села или уважаемого предка, которое затем закрепилось за всем населённым пунктом.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Бедирханлы стоит в одном ряду с такими азербайджанскими фамилиями, как Аббасов, Мамедов, но с принципиально другим суффиксом. Если -ов/-ев и -заде указывают на отчество («сын Аббаса»), то -лы/-ли — на родовую или территориальную принадлежность. Это характерно для фамилий, которые фиксировали не имя отца, а место происхождения семьи. В русской среде такие фамилии встречаются редко и обычно являются прямым заимствованием из тюркских языков, часто без изменения окончания.

Социальный контекст фамилии говорит о том, что её носители, вероятно, происходили из крестьян или ремесленников, живших в определённом селе. В дореволюционной Российской империи азербайджанцы, как и многие другие народы, не имели массово закреплённых фамилий до начала XX века. Фамилия Бедирханлы могла оформиться либо в советское время при паспортизации, когда людей записывали по месту рождения, либо раньше, как родовое прозвание, передаваемое устно. Споров о происхождении корня практически нет: лингвисты и историки сходятся на том, что это классический азербайджанский топонимический оним с прозрачной внутренней формой.