Фамилия Бекарев — редкий пример, где за основой стоит не имя и не профессия, а старинная мера. Прозвище Бекарь, от которого она образована, означало «мера соли». В старину соль была дорогим и стратегическим товаром, и тот, кто ведал её отпуском или хранением, мог получить такое прозвище по роду занятий. Но есть и другая, бытовая версия: «бекарь» — это вообще любая ёмкость для сыпучих продуктов, вроде большой миски или бочонка.

Этимология слова запутанная и показывает, как торговые пути связывали языки. Самая убедительная версия ведёт к языку коми, где «бекар» — это миска или бочка. Северные промыслы и солеварни делают это объяснение правдоподобным для русского Севера и Приуралья. Альтернативные гипотезы выводят слово из древнеисландского bikarr или немецкого Becher («кубок, бокал») — эти варианты связывают прозвище с посудой для питья, но для прозвища по мере соли они менее характерны.

Фамилия образована по стандартной русской модели: суффикс -ев присоединился к основе Бекарь, указывая на принадлежность: «сын Бекаря». В говорах возможен вариант ударения: на первый или на второй слог, что может указывать на разное региональное происхождение носителей. Среди однокоренных фамилий — Бекаров (с характерным для юга России суффиксом -ов) и, возможно, упрощённое Бекар.