Фамилия Бектурганова происходит от тюркского составного мужского имени Бектурган. Её основа складывается из двух слов: «бек» (князь, повелитель, господин) и «турган» (тот, кто остался жив). В буквальном смысле имя Бектурган можно понять как «господин, который выжил» или «князь, оставшийся в живых». Такое имя могли дать ребёнку, родившемуся после трудных родов или в период эпидемии, — как пожелание стойкости и долгой жизни.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов-а, что типично для фамилий, адаптированных в русской среде из тюркских имён. Женская форма Бектурганова указывает на принадлежность к роду, основателем которого был мужчина по имени Бектурган. В тюркской ономастике составные имена с компонентом «бек» были широко распространены у народов Средней Азии, Казахстана, Поволжья и Кавказа, поэтому географически фамилия может указывать на корни из этих регионов.

Процесс закрепления фамилий в тюркских семьях шёл неравномерно: в одних местах — к концу XIX века, в других — уже в советское время. Поэтому точно определить, когда именно появилась фамилия Бектурганова, можно только через генеалогические изыскания. Сама по себе фамилия редкая, что делает её ценной для тех, кто ищет свои родовые связи: носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких родственных ветвей.