Фамилия Белибаева — женская форма, мужской вариант — Белибаев. В основе лежит прозвище или имя Белибай. Разобрать её стоит с конца: суффикс -ев указывает на принадлежность (чей? — Белибаев), то есть «сын Белибая» или «потомок Белибая». Само имя Белибай — сложное, тюркское по происхождению, что типично для фамилий, распространённых среди башкир, татар, казахов и других народов Урало-Поволжья и Приуралья.

Первая часть — «бели» — скорее всего, искажённое или диалектное «бил» (знающий, ведающий) либо «бәлиг» (достигший совершеннолетия, зрелый). В тюркских языках «бил» даёт значение «знаток», «мудрец». Вторая часть — «бай» — означает «богач», «хозяин», «господин». В имени Белибай соединяются эти смыслы: «знающий господин» или «мудрый богач». Такие имена давали не столько для описания реального достатка, сколько как пожелание ребёнку стать уважаемым и состоятельным человеком.

Версия о корне «белый» (от русского «белый» или тюркского «бәл» — отметина) менее вероятна. Если бы основа была «белый», в тюркской среде чаще ожидалось бы Акбай (ак — белый). Белибай — форма, где первая часть звучит как «бели», что ближе к «бил» или «бәлиг».

Фамилия Белибаева встречается в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области. Носители — потомки людей, носивших имя Белибай. Сословно предки могли быть как из крестьян-башкир, так и из служилых татар (тептяри, мишари). Фамилия недворянская, но и не поздняя искусственная — она сложилась естественным путём в XIX веке, когда у тюркских народов начали массово фиксировать фамилии по отцу.

Интересная деталь: в некоторых списках фамилия записывалась как Балибаев или Белибайев — через «а» в первом слоге или с буквой «й» перед суффиксом. Это следы разных говоров и почерков писарей. Современное написание Белибаева закрепилось как основное, но в архивах можно встретить варианты.