Фамилия Бельцын — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, но при ближайшем рассмотрении открывается неожиданный поворот. Суффикс -ын (а не стандартное -ин) сразу выдаёт её происхождение: такие фамилии образовывались от основ на -а или -я. То есть в основе лежит слово «Бельца» или «Бельця» — прозвище, имя или географическое название.

Самая прямая версия — прозвище Бельца. В северных и сибирских говорах «бельцом» называли белку-летягу, а в некоторых диалектах — вообще всё белое, светлое. Прозвище могли дать человеку со светлыми волосами, бледной кожей или, наоборот, за ловкость и подвижность, сродни белке. В ономастике это известная модель: прозвище на -ца (как «Умница», «Красава») переходило в фамилию через суффикс притяжательности.

Вторая, не менее вероятная версия — топонимическая. На карте России есть несколько речек и селений с корнем «Бельц-», например река Бельца в бассейне Оки или деревни Бельцы в бывших Тверской и Смоленской губерниях. Человек, приехавший из такого места, мог получить прозвище Бельца, а его потомки — фамилию Бельцын. В пользу этой версии говорит и тот факт, что фамилия редкая, сконцентрированная в центральных и северо-западных регионах, где такие топонимы встречаются чаще.

Менее убедительно выглядит связь с молдавским городом Бельцы. Хотя это известный топоним, фамилия Бельцын практически не встречается среди потомков бессарабских переселенцев — у них преобладают фамилии на -ский или -ан. Скорее всего, корень чисто русский, диалектный.

Интересно, что фамилия Бельцын не имеет «двойников» с другим суффиксом (например, Бельцов или Бельцев), что говорит о её локальном, почти гнездовом бытовании. Сословно предки могли быть как крестьянами (прозвище по внешности или месту), так и мещанами из северных городов. В дореволюционных записях Бельцыны встречаются в основном среди крестьян Ярославской и Костромской губерний.