Скорее всего, фамилия Бения образована от имени Бени. По одной из версий, оно восходит к турецкому слову «бен» - «родинка». Следовательно, Бени могли называть мальчика с родинкой. Также возможно, что это имя восходит к арабскому «бен» - «сын». Однако не исключено, что Бени — это краткая форма какого-либо христианского имени (например, Беньямин). Это имя имеет древнееврейское происхождение и означает «сын любимейшей из жен». В православном именнике оно появилось в память о святом мученике Беньямине, который жил в царствование Персидского царя Издигерда. Обратив в христианство многих персов-язычников, Беньямин был оклеветан, схвачен, подвергнут жестоким биениям и посажен в темницу, в которой провел два года.