Фамилия Берберов — типичный пример русской фамилии, образованной от прозвища с помощью патронимического суффикса -ов. Суффикс указывает на принадлежность: Берберов буквально означает «сын Бербера» или «из рода Бербера». В основе лежит прозвище Бербер, и здесь исследователи сталкиваются с двумя разными корнями.

Первая версия связывает прозвище с этнонимом «берберы» — коренным населением Северной Африки. В VII веке эти племена были покорены арабами и приняли ислам. Само слово «бербер» восходит, вероятно, к греческому bárbaros («варвар», «чужеземец»). В арабском мире так могли называть любого «не араба» или «неверного». Если прозвище пошло от этого корня, то Бербером на Руси могли прозвать человека, который внешне напоминал жителя Африки — например, смуглой кожей или курчавыми волосами. Либо так называли купца или путешественника, долго прожившего в тех краях и перенявшего местные обычаи.

Вторая, более бытовая версия — армянская. В армянском языке «бербер» означает «цирюльник», то есть парикмахер, который не только стриг и брил, но нередко владел простейшими приемами врачевания (кровопускание, лечение ран). В многонациональной среде юга Российской империи и Закавказья такое прозвище могло закрепиться за человеком этой профессии. Оба варианта имеют право на существование, и выбор между ними зависит от того, в какой именно местности и в какой среде фамилия возникла впервые. Если носители фамилии исторически связаны с армянскими общинами, вторая версия выглядит предпочтительнее. Если же фамилия встречается в регионах, где контакты с Востоком были редки, более вероятно, что прозвище отражало внешность или характер человека.