Фамилия Бердашкова — женская форма фамилии Бердашков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, а не в географическом названии. Основа «Бердаш» имеет несколько возможных корней, и выбор между ними зависит от региона и исторического контекста.

Самая прямая версия — от тюркского слова «бердаш» или «бирдаш», что в ряде тюркских языков означает «ровесник», «однолеток» или «товарищ». В русской среде такое прозвище могли дать человеку, который приходился кому-то ровесником, или же оно закрепилось как внутрисемейное обращение. В пользу этой версии говорит распространённость тюркских корней в русских фамилиях южных и восточных регионов.

Вторая версия — от диалектного русского слова «берда» (или «бердо»). Так называли деталь ткацкого станка — гребень для прибивания утка. «Бердаш» в этом случае — мастер, изготавливающий или использующий такие гребни, то есть ткач или ремесленник. Однако суффикс «-аш» здесь нехарактерен для русского словообразования: обычно мастера называли «бердочник» или «бердник». Если бы фамилия образовалась от ремесла, мы бы скорее увидели Бердников или Бердочников. Поэтому версия с тюркским корнем выглядит убедительнее.

Третья, менее вероятная гипотеза — связь с именем Бердаш как вариантом крестильного имени Варфоломей (в просторечии — Бартоломей, Бардаш). Но для такого перехода нет надёжных лингвистических подтверждений.

Суффикс «-ов» в мужской форме Бердашков указывает на типичную модель образования русских фамилий как притяжательных прилагательных: «чей? — Бердашков», то есть сын или потомок Бердаша. Фамилия могла возникнуть в среде служилых людей или крестьян, контактировавших с тюркским населением, — в Поволжье, на Урале или в южнорусских степях. Географически носители фамилии Бердашковы встречаются в Волгоградской, Ростовской областях и в Ставропольском крае, что косвенно подтверждает тюркскую версию.