Фамилия Бердина — одна из тех, где за простым звучанием скрывается сразу несколько версий происхождения, и выбрать единственную непросто. В основе лежит прозвище Берда, а суффикс -ин указывает на принадлежность: Бердина — «дочь» или «жена» Берды, а в более широком смысле — «из семьи Берды». В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я, что и закрепило форму Бердина.

Самая прямая и материальная версия связывает прозвище с ткацким ремеслом. Берда — это основная рабочая деталь ткацкого станка, похожая на гребень: через неё пропускали нити основы, формируя ткань. Прозвище Берда мог получить либо сам ткач, работавший за таким станком, либо человек, чем-то напоминавший эту деталь — например, худой и прямой, как гребень. В пользу этой гипотезы говорит то, что в старых русских говорах слово «берда» было широко распространено именно в этом значении.

Есть и другая, менее очевидная версия — от украинского «берда» в значении «сторож». Если предок нёс караульную службу или охранял угодья, его могли прозвать Бердой по роду занятий. Это редкое, но возможное объяснение для фамилий, бытующих на южнорусских и украинских территориях.

Третья версия отталкивается от глагола «бердить» — «подавшись вперёд, пятиться, откачиваться назад». Так говорили о человеке нерешительном, который делает шаг вперёд, а потом отступает, колеблется. Прозвище Берда в этом случае отражало бы черту характера: осторожность или неуверенность. Эта гипотеза правдоподобна, но уступает «ткацкой» по распространённости — в письменных источниках прозвища по глаголам встречаются реже, чем по названиям орудий труда.

Географически фамилия Бердина встречается в разных регионах, но чаще всего фиксируется в центральной России и Поволжье, что косвенно поддерживает версию с ткачеством — это были районы развитого домашнего ремесла. Однокоренные фамилии — Бердин, Бердников, Бердов — все они восходят к той же основе, но различаются суффиксами: Бердников, например, прямо указывает на ремесленника, делавшего или использовавшего «берда».