Фамилия Бердины (в форме мужского рода — Бердин) ведет свою историю от прозвища Берда. Это прозвище, скорее всего, относилось к роду занятий предка. В основе лежит слово «берда» — основная рабочая деталь ткацкого станка, гребень, через который пропускают нити основы. Ткачество было одним из главных домашних ремесел на Руси, так что прозвище мог получить либо сам ткач, либо мастер, изготавливавший эти детали.

Впрочем, у слова «берда» есть и другие значения. В украинских говорах «берда» — это сторож, что также могло стать источником прозвища. Есть и третья версия: от глагола «бердить» — подавшись вперед, пятиться назад, колебаться. В этом случае прозвище отражало бы черту характера: неуверенность или, наоборот, осторожность и осмотрительность.

Фамилия образована по самой распространенной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — «Бердин», то есть сын или потомок Берды. Такая модель типична для прозвищ и имен, оканчивающихся на -а. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имен на твердый согласный, -ин — верный признак того, что основа звучала как Берда.

О точном месте и времени возникновения фамилии сейчас говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным, и разные ветви рода могли получить фамилию независимо друг от друга в разных регионах.