Фамилия Бердзения — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается важнее разбора по суффиксам. Она почти наверняка грузинского происхождения, и чтобы понять её корни, нужно смотреть не на привычную русскую модель «-ов/-ев», а на закавказскую ономастику.

Основа фамилии — «Бердзен». В грузинском языке это слово имеет два значения, и оба могли дать прозвище. Первое — «мудрый», «учёный» (от грузинского «бердзени» — мудрец, учёный человек). Второе, более конкретное, — «грек». В исторической Грузии греков называли «бердзени», и фамилия могла указывать на этническое происхождение предка: выходца из греческой общины, переселенца или торговца. Какая из версий вероятнее — сказать сложно, но обе имеют под собой реальную основу.

Окончание «-ия» — типичный грузинский фамильный суффикс, характерный для западных регионов Грузии, особенно Мегрелии и Гурии. Такие фамилии, как Бердзения, не склоняются по падежам в русском языке, что тоже выдает их нерусское происхождение. Встречаются и родственные формы — Бердзени, Бердзенов (последняя — уже русифицированный вариант, когда к грузинской основе добавили русский суффикс).

В дореволюционных документах фамилия могла записываться по-разному — через «е» или «э» (Бердзэния), с одним или двумя «н». Вариативность объясняется передачей грузинских звуков русскими буквами. Сословно носители фамилии не были привязаны к дворянству или крестьянству — среди Бердзения встречались и священники, и купцы, и крестьяне. Точных данных о численности нет, но фамилия редкая, за пределами Грузии и грузинских диаспор (в России, Турции) почти не встречается.

Что касается значения — фамилия говорит либо об уме и образованности предка, либо о его греческих корнях. В любом случае, это не прозвище по ремеслу или внешности, а скорее указание на происхождение или личное качество.