Фамилия Беспальчий — один из тех редких случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не требует расшифровки. Корень здесь — «палец», а приставка «бес-» (в старом написании «без-») указывает на отсутствие. Беспальчий — человек без пальца или без нескольких пальцев. Прозвище могли дать тому, кто лишился пальца в бою, на охоте или во время ремесленной работы, — скажем, кузнецу или плотнику, получившему тяжёлую травму. В крестьянской среде, где физическая полноценность была важна для любого труда, такая примета сразу бросалась в глаза и закреплялась в бытовом имени.

Словообразовательная модель фамилии необычна. В русских фамилиях чаще встречаются суффиксы -ов, -ин, -ский, а тут мы видим окончание -ий, типичное для прилагательных. Это указывает на так называемые «украинские» или «южнорусские» корни: фамилии на -ий (Беспальчий, Криворучко, Безрукий) распространены на Украине, в Белоруссии и в южных областях России. В украинском языке форма «Безпальчий» встречается чаще, а русское написание с «с» — результат адаптации к литературной норме. Таким образом, предки носителя фамилии, скорее всего, происходили с территории современной Украины или юга России.

В ономастике фамилия Беспальчий относится к группе «дефектных» прозвищ — таких, которые описывали физический недостаток. В эту же группу входят Безруков, Кривошеин, Хромов. Но, в отличие от них, Беспальчий сохранил прямую описательность: он не стал фамилией на -ов, а остался в форме прилагательного, что встречается реже. В дореволюционных документах можно встретить варианты написания: «Безпальчий» (с буквой «з») и «Беспальчий» (с «с»), причём второй вариант закрепился из-за оглушения согласной на письме.

География фамилии сегодня не слишком широка: Беспальчие встречаются в основном в Краснодарском крае, Ростовской области и на Украине. Это подтверждает версию о южном происхождении. Сословное положение предков, скорее всего, было крестьянским или казачьим — именно в этих средах прозвища, данные по внешним приметам, легко переходили в фамилии и закреплялись за целым родом.