Фамилия Биндокас — литовского происхождения, и её основа — христианское имя Бенедикт. В переводе с латинского Benedictus означает «благословенный», по другой версии — «тот, о ком хорошо говорят». В Литве имя Бенедикт адаптировали в народную форму Биндас или Биндокас, а фамилия образовалась от неё с помощью литовского суффикса -ас, который типичен для мужских фамилий и указывает на принадлежность к роду.

Словообразовательная модель проста: корень Бинд- (от Биндас) плюс суффикс -ок- (уменьшительно-ласкательный или производный) и окончание -ас. По сути, Биндокас — это «сын Биндаса» или «маленький Биндас», то есть потомок человека, которого в быту звали Биндокасом. Такая модель характерна для литовской ономастики, где фамилии часто закрепляли прозвища или уменьшительные формы имён.

Географически фамилия сосредоточена в Литве, особенно в северных и центральных регионах, где исторически было сильно влияние католической традиции с её культом святых. Встречается также среди литовских диаспор в США и Великобритании. В русском контексте фамилия редкая и воспринимается как иноязычная, но её носители могли переселиться в Россию ещё в XIX веке, когда Литва входила в состав Российской империи.

Спорных версий происхождения нет: лингвистическая связь с именем Бенедикт очевидна, и альтернативные гипотезы (например, от балтского корня «binda» — «связывать») не выдерживают критики, так как не объясняют суффиксальную структуру. Социальный контекст: фамилия не указывает на дворянское происхождение — скорее, на крестьянское или мещанское, так как литовские фамилии на -ас часто закреплялись за простыми людьми в XV–XVII веках, когда шёл процесс массовой христианизации и фиксации прозвищ.