Фамилия Биннатов образована от имени Биннат, в основе которого лежит арабское нарицательное «бинат», что в переводе на русский язык означает «дочь». Вероятно, таким именем родители нарекли первую родившуюся девочку в семье. Согласно другой версии, фамилия Биннатов образована от прозвища Биннат, которое восходит к лезгинскому «бинат» - «тысяча лошадей». В этом случае можно предположить, что прозвище относится к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка. Так, Биннатом могли прозвать человека, занимающегося коневодством, или торговца лошадьми. Появление в фамилии удвоенной согласной «н» объясняется историческими процессами, происходившими в ходе развития языка. Таким образом, потомок человека, которого звали Биннатом, со временем получил фамилию Биннатов.